De thema's in het museum zijn:
- IJstijddieren uit Nederland en de omgeving van Langedijk.
- De ontstaansgeschiedenis van de kuststreek in Noord-Holland en de strandwal van Sint Pancras.
- Schelpen en zeedieren uit de Noordzee en de wereldzeeen.
- Diorama met zoogdieren en vogels van strand, duin en polderland.
- Vlinders en insecten uit Nederland en de gehele wereld.
- Historische vogelfotografie met stereoscopische opnamen uit 1900.
- De geschiedenis van de aarde en het klimaat met gesteenten en mineralen uit de gehele wereld.
Nieuwe/Vernieuwde tentoonstellingen in het jaar 2012
- Natuur en historie in en rond het Geestmerambacht
In de z.g.n. Geestmerambachtkamer op de benedenverdieping wordt de geologische en de natuurhistorische geschiedenis van de regio en de oude strandwal van Sint Pancras getoond. Aansluitend daarop is een presentatie van vogels, dieren, libellen, vlinders en bijzondere paddenstoelen ingericht die daar in de huidige natuur voorkomen. - Archeologische vondsten uit onze regio
In samenwerking met de stichting "Regionale Archeologen Gheestmanambocht" en de "Archeologische Werkgroep Nederland Kop van Noord-Holland" presenteerd Westflinge dit jaar een tentoonstelling van archeologische vondsten uit onze regio.
Jeugdvitrine
De jeugdvitrine wordt dit jaar ingericht door leerlingen van de groepen 7 en 7/8 van de "RK Paus Johannesschool" in Sint Pancras. De leerlingen laten hun mooiste stukken zien uit hun verzameling en presenteren tegelijk een collectieve belangstelling voor de natuur.
Het museum beschikt ook over:
- Leerplekken voor het determineren van Noordzee schelpen, gesteenten en insecten.
- Een bibliotheek met natuurboeken.
- Een educatieve jeugdhoek.
- Twee plaatsen waar speciale natuurfilms vertoont kunnen worden.
- Diverse puzzeltochten aangepast aan de leeftijd van de jeugdige bezoekers.